Ngày 12 tháng 5 năm 1964, Bộ Nội vụ ban hành Quyết định số 150-NV.[2] Theo đó:

• Đổi tên xã Cao Phong thành xã Xuân Lạc
• Đổi tên xã Lạc Long thành xã Đồng Lạc
• Đổi tên xã Tân Phong thành xã Quảng Bạch
• Đổi tên xã Thắng Lợi thành xã Nghĩa Tá
• Đổi tên xã Thành Công thành xã Yên Mỹ
• Đổi tên xã Đại Thắng thành xã Đại Sảo
• Đổi tên xã Đồng Thắng thành xã Đông Viên
• Đổi tên xã Đức Thượng thành xã Rã Bản.

Sau năm 1975, huyện Chợ Đồn thuộc tỉnh Bắc Thái, gồm 21 xã: Bản Thi, Bằng Lãng, Bằng Phúc, Bình Trung, Đại Sảo, Đồng Lạc, Đông Viên, Lương Bằng, Nam Cường, Nghĩa Tá, Ngọc Phái, Phong Huân, Phương Viên, Quảng Bạch, Rã Bản, Tân Lập, Xuân Lạc, Yên Mỹ, Yên Nhuận, Yên Thịnh, Yên Thượng.

Ngày 8 tháng 4 năm 1985, tách phố Bằng Lũng gồm 1.853 ha của xã Ngọc Phái để thành lập thị trấn Bằng Lũng, thị trấn huyện lỵ huyện Chợ Đồn.

Ngày 6 tháng 11 năm 1996, tái lập tỉnh Bắc Kạn từ tỉnh Bắc Thái cũ, huyện Chợ Đồn thuộc tỉnh Bắc Kạn.

Ngày 10 tháng 1 năm 2020, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết số 855/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã thuộc tỉnh Bắc Kạn (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 2 năm 2020)[3]. Theo đó:

• Sáp nhập 2 xã Đông Viên và Rã Bản thành xã Đồng Thắng
• Sáp nhập thôn Bản Cưa của xã Phong Huân vào xã Bằng Lãng
• Sáp nhập 5 thôn: Nà Tấc, Pác Cộp, Nà Chợ, Nà Mạng, Khuổi Xỏm thuộc xã Phong Huân và xã Yên Nhuận thành xã Yên Phong.

Huyện Chợ Đồn có 1 thị trấn và 19 xã như hiện nay.